以风摩小太郎（天津敏）为首领的小田原风摩一族忍者，连续两天闯入江户城，杀害了负责警备的伊贺同心忍者，从吹上御庭的井中夺走了《水虎之镜》。据说集齐水虎、风雷、火龙三面镜子，就能知晓北条早云留下的百万枚黄金的藏匿之处。风雷之镜在相州屋的女儿香（岸久美子）手中，火龙之镜则在小田原的尼姑光信女（三影千绘）那里。风摩小太郎为了复兴风摩一族，企图得到百万枚黄金，进而盯上了剩下的两面镜子。以江户和小田原为舞台，秋草、遁兵卫和伊贺同心追寻三面镜子和宝物的下落，与风摩一族展开战斗。在第二部至第四部中饰演敌方忍者副首领的天津敏，在这部第五部中晋升为头领角色。

秋草一行人带着三面镜子来到目的地江之岛的洞窟，然而这里并没有宝藏，而是新发现了一张指示藏匿地点的绘地图。凭借这张地图，秋草等人再度踏上寻找北条家百万枚黄金的旅途。就在此时，原以为已全军覆没的风摩一族出现在他们面前。风摩小太郎（天津敏）新召集了风摩十人群，觊觎着秋草手中的宝藏绘地图。故事场景随着绘地图上所记载的风之寨、水之城、火之橹不断转换，秋草与风摩一族围绕着百万枚黄金的战斗，在八王子、甲州路、相州路等地持续展开。

大瀬康一版结束后的第二周，以林真一郎为主演的新作全新开播。企图倒幕的萨摩藩盯上了记载九州诸藩秘密的卷轴“天地二卷”。影一族的真之介为守护卷轴，不断与刺客展开战斗。

德川二代将军秀忠时代，家康之孙松平信太郎在禅寺中长大，过着与政治无关的生活。一日，信太郎救下一名遭忍者集团袭击而受伤的忍者，此人名叫贺夜猿，是伊贺的逃忍。机缘巧合下，信太郎接到大御所家康的命令。原来，家康忧虑支持秀忠的本多上野介掌控政治实权，利用伊贺忍者推行残酷政策。为回应家康“代替自己惩处天下恶行、纠正政治错误”的愿望，信太郎为了正义踏上旅程。 主人公隐秘剑士松平信太郎由荻岛真一饰演，这部作品将时代剧与青春剧氛围相融合。配角方面，曾在前作中饰演雾之遁兵卫的牧冬吉扮演信太郎的搭档贺夜猿，而在前作中就出演反派的天津敏，此次饰演率领赤目十人群的宿敌赤目幻幽斉，延续了系列风格。

小师爷充满智慧和勇气，梦想成为一名顶天立地的师爷，并得到《师爷宝典》。一个神秘人物出价黄金千两收购《师爷宝典》，形形色色的人为了得到千两黄金，纷纷赶往江南古城寻找《师爷宝典》，给江南古城和小师爷家带来了麻烦。小师爷顺藤摸瓜，找到了幕后神秘人，解决危机。

松平定信（加賀邦男）的江户屋敷来了自称来自甲贺的幻之谷的“幻之众”七名甲贺忍者。幻之众称是受定信邀请而来，但定信并无印象。负责定信身边警卫的伊贺忍者被幻之众当作试手，轻易打倒，幻之众离开定信屋敷后，甲贺五十三家笔头忍者·甲贺的金刚（天津敏）出现，告知幻之众是被黑暗御大老招来的。对定信怀有个人怨恨的黑暗御大老，命令金刚和幻之众暗杀定信的心腹奉行们、幕府御用豪商，以及秋草和雾之遁兵卫等总计二十一人，目的是孤立定信使其失势。目付役笔头遭幻之众暗杀的现场被秋草撞见，秋草与遁兵卫、伊贺同心三之组的忍者们合作，为阻止暗杀计划，以江户为舞台与甲贺的金刚和幻之众展开对决。 这部第八部使用了东映京都摄影所……

以甲贺白云斉（小林重四郎）为首的甲贺忍者集团，其忍者・いざないの夢助不断对江户的商家进行袭击。这背后是尾张德川家的阴谋，他们企图借此恶化治安，让将军家斉失势。两年前，受松平定信命令潜入尾张藩后便行踪不明的伊贺同心・大月五郎太，在身负濒死重伤的情况下，于归途中知晓了闇法師的存在。曾在第三部登场、被秋草改造了右腕的“伊贺十忍”成员水口幻斉，此次作为闇法師的帮手再度现身。而暗中操控闇法師和尾张藩的幕后黑手・闇の御隠居，向对幕府政策持批判态度的全国谱代大名发出号召，让他们在赞同尾张德川家的连判状上署名，打算在全国大名齐聚的日光东照宫举行的德川家康大法要上，以连判状为依仗，迫使家斉将军退位……

天明7年（1787年），担任老中首座及将军辅佐役的松平定信（美川洋一郎），为重建幕府财政，委托秋草去探索虾夷地的资源。松前藩收到江户藩邸报告，称有公仪隐秘潜入虾夷。藩主松前志摩守道广（立松晃）误以为幕府要让他们藩国替到别的地方，因而愤怒不已，他命令松前藩第一剑客、甲源一刀流高手鬼场阵十郎（胜木敏之）去抹杀隐秘秋草。秋草一边救助被不法之徒、缺德商人以及阿伊努凶恶酋长等恶人欺虐的虾夷地开拓民和善良的阿伊努民族，一边与紧追不舍的鬼场阵十郎展开战斗。

钩钩岛，一个绿野仙踪到处充满奇迹的神秘小岛。传说在钩钩岛，每100年，就会评选出一位“钩钩岛最聪明的人”，拥有这一称号的人将会拥有强大的能量，并能带领钩钩岛走向繁荣。爱思考、爱探索的四年级小学生酷酷小吉与虚荣自负的发明家朵猫猫为了得到这一称号展开竞争。酷酷小吉选择去探索每一个未知问题的答案，在一系列的探索过程中，酷酷小吉发现，平凡的表象之下隐藏着一个个奇迹，大人们都无法相信的奇迹。朵猫猫为了达到目的，选择用自己的现代发明去改造世界。可急功近利的改造行为总是会变成破坏环境、引发环境危机的罪魁祸首。酷酷小吉总是能够利用在探索答案过程中遇到的奇迹，化解一次次的环境危机。

真之介完成使命后回到了阿蘇谷，然而听闻丹波再次得到了九州掌握秘巻的传言，他便与伊賀同心・霧の遁兵衛一同前往薩摩。